4.2.0-1 版本说明
重大性能改进。
支持高达 500 个碱基对的读取长度。
已更新至 GATK 4.3。
支持高达 500 个碱基对的读取长度。
添加了对
--htvc-bam-output
选项的支持。--batch
已弃用。
已更新至 GATK 4.3。
支持高达 500 个碱基对的读取长度。
添加了对
--run-partition
选项的支持。
已更新至 GATK 4.3。
澄清了错误消息。
跨多个工具的改进
在使用
--gpuwrite
写入 BAM 文件时添加了更多错误检查。改进了 BWA 比对的性能,特别是对于长度 > 250 个碱基的读取。
为 fq2bam (BWA-MEM + GATK) 和相关管线添加了 GPUDirect Storage (GDS) 支持。
为
--gpuwrite
添加了低内存模式(影响排序)。
deepvariant 之前只能处理每个候选位点 32 个备选等位基因;现在可以处理多达 64 个。
bamsort Bamsort 可能会在某些坐标排序中失败。
有关更多信息,请参阅 Parabricks 数据表。