NVIDIA 文档中心 NVIDIA Clara Clara Parabricks v4.4.0 获取示例数据

获取示例数据

使用以下命令下载示例数据。此数据将用于教程示例中。

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            $ wget -O parabricks_sample.tar.gz \
"https://s3.amazonaws.com/parabricks.sample/parabricks_sample.tar.gz"

注意

tar 文件为 11GB，解压后将占用额外的 16GB。

使用此命令解压数据

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            $ tar xvf parabricks_sample.tar.gz
parabricks_sample/
parabricks_sample/Data/
parabricks_sample/Data/markdup_input.bam
parabricks_sample/Data/sample_2.fq.gz
parabricks_sample/Data/sample_1.fq.gz
parabricks_sample/Data/singled_ended.bam
parabricks_sample/Ref/
parabricks_sample/Ref/Homo_sapiens_assembly38.fasta
parabricks_sample/Ref/Homo_sapiens_assembly38.fasta.pac
parabricks_sample/Ref/Homo_sapiens_assembly38.fasta.ann
parabricks_sample/Ref/Homo_sapiens_assembly38.known_indels.vcf.gz.tbi
parabricks_sample/Ref/Homo_sapiens_assembly38.fasta.amb
parabricks_sample/Ref/Homo_sapiens_assembly38.dict
parabricks_sample/Ref/Homo_sapiens_assembly38.fasta.fai
parabricks_sample/Ref/Homo_sapiens_assembly38.known_indels.vcf.gz
parabricks_sample/Ref/Homo_sapiens_assembly38.fasta.bwt
parabricks_sample/Ref/Homo_sapiens_assembly38.fasta.sa

您现在可以尝试教程其余部分中显示的示例命令。

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