在 nf-core 上运行 NVIDIA Parabricks

本指南介绍如何在 nf-core 上运行 Parabricks。

Parabricks 是一个加速计算框架，支持基因组学行业的各种应用，主要支持 DNA、RNA 和体细胞突变检测应用的分析工作流程。凭借行业领先的计算速度，Parabricks 可以使用多种经过行业验证的变异调用器快速将 FASTQ 文件转换为 VCF，并且还包括对这些变异进行 QC 和注释的功能。由于 Parabricks 基于公开可用的工具，因此结果易于验证，并可与其他公开可用的数据集结合使用。

更多信息请访问 Parabricks 产品页面。

详细的安装、使用和调优信息请参考 Parabricks 用户指南。

在 nf-core 上可以找到多个 Parabricks 流程作为模块。这些模块可以添加到现有工作流程中或单独使用。要了解更多关于 nf-core 模块的信息，请参阅他们的 文档。

要查找可用的 Parabricks 模块，请访问 nf-core 模块 页面并搜索“Parabricks”。以下模块可用

点击任何模块都会将您带到该模块的主页。此页面显示了用于安装此模块的 nf-core CLI 命令，以及关于预期输入和输出的信息。

可以通过运行以下命令安装此模块

并且可以使用以下命令在本地进行测试

有关如何将此模块集成到现有流程中的更多详细信息，请参阅 nf-core 文档。