键特征器
RingFeaturizer
基类:BaseBondFeaturizer
用于特征化键的环成员关系的类。
源代码位于 bionemo/geometric/bond_featurizers.py
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n_dim: int
property
返回计算出的特征的维度。
__init__(n_ring_sizes=7)
初始化 RingFeaturizer 类。
源代码位于 bionemo/geometric/bond_featurizers.py
30 31 32 |
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get_bond_features(mol, bond_indices)
计算分子中键所在的环的大小。
参数
名称 | 类型 | 描述 | 默认值 |
---|---|---|---|
mol
|
Mol
|
RDkit Chem.Mol 对象 |
必需 |
bond_indices
|
Optional[Iterable]
|
用于特征计算的键的索引。默认情况下,计算所有键的特征。 |
必需 |
返回
类型 | 描述 |
---|---|
list[tuple[int]]
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指示键所在的环大小的元组列表。 |
源代码位于 bionemo/geometric/bond_featurizers.py
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